CYP2C9 -mer detaljer om genvariantene
CYP2C9-genet er lokalisert på kromosom 10q24.1 i et kluster sammen med genene CYP2C8, CYP2C19 og CYP2C18. Det er rapportert om minst 50 CYP2C9-genvarianter (www.cypalleles.ki.se). Det er begrenset kunnskap om mange av variantene, men flere genvarianter har blitt assosiert med redusert enzymaktivitet. Allelet som gir normal enzymaktivitet kalles CYP2C9*1. I europeiske populasjoner er CYP2C9*2 og *3 de to vanligste variantallelene som gir redusert enzymfunksjon.
CYP2C9-genvarianter som analyseres ved Rikshospitalet, Oslo universitetssykehus:
Genvariant (allel) | Sekvensposisjon1 | Effekt av genvariant | Allelfrekvens2 |
---|---|---|---|
CYP2C9*1 |
Normal enzymaktivitet3 |
– |
|
CYP2C9*2 |
c.430C>T |
Aminosyreendring og ca. 30-40 % reduksjon i enzymaktivitet4 |
Kau: 10–29 % |
CYP2C9*3 |
c.1075A>C |
Aminosyreendring og ca. 80-90 % reduksjon i enzymaktivitet4 |
Kau: 4–21 % |
2 Allelfrekvens basert på data fra Alamut/dbSNP, PharmGKB og Ross KA et al. J Hum Genet. 2010 (PMID: 20555338). Forekomsten av genvarianter kan være høyere eller lavere i andre (sub)populasjoner. 3 CYP2C9*1 (villtype) betyr at ingen av de vanligste variantene som gir redusert enzymaktivitet blant kaukasiere (CYP2C9*2 og *3) er påvist. Blant individer med afrikansk opphav forekommer det imidlertid relativt hyppig andre genvarianter (f.eks. CYP2C9*5, *6, *8 eller *11) med betydning for CYP2C9-enzymaktivitet. 4Johnson JA et al. Clin Pharmacol Ther. 2011. (PMID: 21900891) Forkortelser: Kau = kaukasisk, Af = afrikansk, As = asiatisk opphav |
Av Sara Bremer & StB [lastupdated format=»d.m.y» before=»(Oppdatert pr.» after=»)»]
Sist oppdatert 4.september 2018