- Analyse: Metylentetrahydrofolat reduktase (MTHFR) –genotyping
- Indikasjon:
- Utredning av arvelig hyperhomocysteinemi ved høye homocysteinnivåer i plasma.
- Behandling med cytostatika som for eksempel metotreksat, fluoropyrimidiner og platinaforbindelser.
NB: Eventuell betydning av MTHFR-genotype for respons og toksisitet av metotreksat og andre cytostatika er ikke avklart. (Se kommentar lenger ned)
- Prøvemateriale:
- EDTA-fullblod, volum: 0,5 mL (helst 1mL)
- Prøvetakingstidspunkt: Ingen restriksjoner
- Oppbevaring: Prøven er holdbar flere døgn i romtemperatur, men oppbevaring i kjøleskap anbefales. Ved lengre tids lagring (>1 mnd) bør prøven fryses.
- Forsendelse: Ordinær post, romtemperatur.
- Analysemetode:
- Sanntids-PCR med alleldeteksjon vha. hybridiseringsprober og smeltekurveanalyse
–Apparatur: LightCycler®480 (Roche®) - Analysen omfatter følgende MTHFR-genvarianter (alleler):
- NM_005957.4:c.665C>T (rs1801131); NP_005948.3:p.Ala222Val
(Varianten er tidligere kjent som c.677C>T) - NM_005957.4:c.1286A>C (rs1801133); NP_005948.3:p.Glu429Ala
(Varianten er tidligere kjent som c.1298A>C)
Denne gen-analysen er ikke akkreditert.
- NM_005957.4:c.665C>T (rs1801131); NP_005948.3:p.Ala222Val
- Sanntids-PCR med alleldeteksjon vha. hybridiseringsprober og smeltekurveanalyse
- Svarrapportering:
- Svartid: vanligvis innen 2 uker, ta kontakt dersom det haster mer.
- MTHFR-genotype (allelkombinasjon) rapporteres basert på det samlede resultatet etter analyse av MTHFR-variantene c.665C>T (tidligere kjent som c.677C>T) og c.1286A>C (tidligere kjent som c.1298A>C).
- Genotypesvaret inkluderer en kort tolkning av betydningen av MTHFR-genotype i forhold til homocysteinnivåer.
- Forekomst av andre sjeldne sekvensvarianter som kan ha betydning for MTHFR-enzymaktiviteten kan ikke utelukkes.
- Kontakt oss ved spørsmål om analyseresultater, vurdering osv.
- Funksjon av MTHFR-enzymet:
- MTHFR-enzymet spiller en viktig rolle i metabolismen av folat og homocystein.
- MTHFR katalyserer omdannelsen av 5,10-metylentetrahydrofolat til 5-metyltetrahydrofolat, som igjen fungerer som en metyldonor og bidrar til at homocystein omdannes til metionin.
- MTHFR-enzymet er involvert i DNA-syntese og -metylering.
Svartolkning –ved genotyping av MTHFR
Les mer her om:
MTHFR ved utredning av forhøyet homocystein
MTHFR i relasjon til behandling med cytostatika
Tolkninger
MTHFR ved utredning av forhøyet homocystein
- Ved spørsmål om analyse og tolkning av MTHFR-genotyping ved utredning av forhøyet homocystein, ta kontakt med Seksjon for medfødte metabolske sykdommer, Avd. for medisinsk biokjemi, OUS, Rikshospitalet –tlf.: 23 07 10 48
- Svar: Ingen av de undersøkte sekvensvariantene er påvist (dvs. C/C i posisjon c.665 og A/A i posisjon c.1286).
o Tolkning: Genotypen påvirker sannsynligvis ikke MTHFR-aktivitet og homocysteinkonsentrasjon i særlig grad. - Svar: Pasienten er heterozygot C/T i posisjon c.665 i MTHFR-genet, og evt. også heterozygot A/C i posisjon c.1286.
o Tolkning: Genotypen kan gi redusert MTHFR-enzymaktivitet og føre til lett økt homocysteinkonsentrasjon, særlig ved lave folatnivåer. Behandling med folsyre kan i så fall redusere homocysteinkonsentrasjonen. - Svar: Pasienten er heterozygot C/T i posisjon c.665 i MTHFR-genet og i tillegg homozygot C/C i posisjon c.1286.
o Tolkning: Genotypen er assosiert med redusert MTHFR-enzymaktivitet og kan føre til økt homocysteinkonsentrasjon, særlig ved lave folatnivåer. Behandling med folsyre kan i så fall redusere homocysteinkonsentrasjonen. - Svar: Pasienten er homozygot T/T i posisjon c.665 i MTHFR-genet, og evt. også heterozygot A/C eller homozygot C/C i posisjon c.1286.
o Tolkning: Genotypen er assosiert med redusert MTHFR-enzymaktivitet og kan føre til økt homocysteinkonsentrasjon, særlig ved lave folatnivåer. Behandling med folsyre kan i så fall redusere homocysteinkonsentrasjonen. - Svar: Pasienten er heterozygot A/C eller homozygot C/C i posisjon c.1286 i MTHFR-genet (men normalsekvens, dvs. C/C, i posisjon c.665).
o Tolkning: Genotypen påvirker sannsynligvis ikke MTHFR-aktivitet og homocysteinkonsentrasjon i særlig grad. - Klinisk betydning av MTHFR-genotype avhenger også av andre faktorer som påvirker homocysteinnivåer som f.eks.:
• Livsstil
o Kosthold og vitamininntak, røyking, alkohol
• Sykdommer
o Maligne tilstander, hypotyreose, reumatoid artritt, nyresykdommer
• Legemidler
• Alder, graviditet
MTHFR i relasjon til behandling med cytostatika
– mer info kommer
- Mer informasjon om MTHFR-genanalyse i forbindelse med legemiddelbehandling, se https://www.pharmgkb.org/gene/PA245
- …